Alþjóðaskólinn í Lyon er sjálfseignarstofnun (French Loi 1901). Stofnaðilar iðnaðarins eru BayerCrop Science, Lafarge, Merial, Monsanto og Renault Trucks. Upphaflega áttu þessi fyrirtæki öll fulltrúa í stjórninni sem kallast „stjórnin“. Í dag hafa önnur fyrirtæki eða samtök bæst við.
Stjórnin, ásamt forstöðumanni, hittast reglulega til að hafa umsjón með starfsemi skólans og starfsemi hans, einkum fjármálastöðugleika hans. Stjórnin hefur yfirumsjón með starfi forstöðumanns sem gefur reglulega skýrslur um starfsemi og fjárhag skólans og vinnur náið með henni að stefnumótandi framgangi skólans. Stjórninni var hrósað af úttektarteymi IB PYP nýlega fyrir langvarandi skuldbindingu sína við, stuðning við og persónulega fjárfestingu í þróun ISL.
Aðalstjórnarmenn yfirstandandi skólaárs eru: