בית הספר הבינלאומי של ליון הוא עמותה ללא מטרות רווח (צרפתית לוי 1901). החברים התעשייתיים המייסדים שלה הם BayerCrop Science, Lafarge, Merial, Monsanto ו-Renault Trucks. במקור, לכולן היו נציגים בגוף המנהל המכונה 'הדירקטוריון'. היום הצטרפו חברות או ארגונים נוספים.
המועצה, יחד עם המנהל, מתכנסים באופן קבוע כדי לפקח על תפקוד בית הספר ופעילותו, במיוחד על היציבות הפיננסית שלו. הוועדה מפקחת על עבודת המנהלת המספקת דוחות שוטפים על פעילות בית הספר ועל כספיו ופועלת עמה בצמוד לקידום האסטרטגי של בית הספר. מועצת המנהלים זכה לשבחים על ידי צוות ההערכה של IB PYP לאחרונה על מחויבותו ארוכת השנים לפיתוח ISL, התמיכה וההשקעה האישית שלו.
חברי ההנהלה הראשיים של שנת הלימודים הנוכחית הם: