International School of Lyon on voittoa tavoittelematon yhdistys (French Loi 1901). Sen perustajajäseniä ovat BayerCrop Science, Lafarge, Merial, Monsanto ja Renault Trucks. Alun perin näillä yrityksillä oli edustajia hallintoelimessä, joka tunnetaan nimellä "hallitus". Nykyään muita yrityksiä tai organisaatioita on liittynyt mukaan.
Hallitus ja johtaja kokoontuvat säännöllisesti valvomaan koulun toimintaa ja toimintaa, erityisesti sen taloudellista vakautta. Hallitus valvoo koulun toiminnasta ja taloudesta säännöllisesti raportoivan johtajan työtä ja tekee hänen kanssaan tiivistä yhteistyötä koulun strategisessa edistämisessä. IB PYP:n arviointiryhmä kiitti hallitusta äskettäin sen pitkäaikaisesta sitoutumisesta, tukemisesta ja henkilökohtaisesta panostuksesta ISL:n kehittämiseen.
Johtokunnan jäsenet kuluvalla lukuvuodella ovat: